磁性测厚仪和光热测厚仪是两种不同的测量材料厚度的方法，其适用范围和测量原理不同，因此在选择哪个更好时需要根据具体应用场景和被测物体的特点进行综合考虑。
磁性测厚仪是一种利用磁性感应原理进行测量的接触式测厚方法，适用于测量磁性材料的厚度，如钢板、铁板等。其测量精度较高，可以达到数微米的级别，速度较快，适用于现场快速测量。但是，由于其测量原理的特殊性，其测量精度受到多种因素的影响，如被测物体的表面粗糙度状况、底材的磁性变化、表面形状等，因此在使用时需要注意校准和控制测量条件。
光热测厚仪是一种利用红外线热辐射和传导原理进行测量的非接触式测厚方法，适用于测量非磁性材料的厚度，如塑料、橡胶、玻璃、金属等。其优点是适用范围广，可以测量各种材料的厚度，但测量精度受到环境温度、湿度、表面状态等因素的影响。
因此，在选择磁性测厚仪和光热测厚仪时，需要根据被测物体的特点和需要进行综合考虑。